يعيـن قاضـي تطبيـق العقـوبـات بموجـب قـرار من وزيـر العـدل، حافـظ الأختـام و يختـار مـن بين القضاة المصنفيـن في رتـب المجلس القضائـي و ممن لهـم درايـة و يولون عناية خاصة بمجال السجون.
يختص قاضي تطبيق العقوبات بالسهر و الإشراف و مراقبة مشروعية تطبيق العقوبات السالبة للحرية و العقوبات البديلة عند الاقتضاء و على ضمان التطبيق السليم لتدابير تفريد العقوبة. كما يترأس لجنة تطبيق العقوبات المنصبة على مستوى كل مؤسسة عقابية.